Przemianom energii towarzyszą przemiany materii. Każdy żywy organizm cechuje zdolność do przemiany materii i energii, czyli metabolizm. Jego intensywność zależy między innymi od sposobu odżywiania, wielkości, wieku i warunków siedliskowych danego organizmu. Podobnie rzecz ma się z systemami ekologicznymi, takimi jak ekosystemy. W zależności od wielkości, składu gatunkowego, relacji wewnętrznych i warunków abiotycznych krążenie materii w ekosystemach przebiega nieco odmiennie.