Cesarzowa Agnieszka
, regentka małoletniego
Henryka IV
, wysunęła
Honoriusza
na
antypapieża
. Obaj papieże wyzwali się nawzajem od morderców. Aleksander II był pierwszym papieżem wybranym przez kolegium kardynałów.
W 1063 papież Aleksander II ogłosił apel do wszystkich narodów chrześcijańskich, by wspierały Hiszpanów w walce z wrogami chrześcijaństwa.