Specyficzność enzymów da się wyjaśnić za pomocą przykładu pasującego do zamka
klucza. W ten sam sposób dopasowany jest substrat do centrum
aktywnego. Jest to wizualne wyjaśnienie specyfiki enzymów, jednak samo dopasowanie nie
substratu do centrum aktywnego nie jest w stanie w tak dużym stopniu obniżyć energię aktywacji.
Pełniejsze wyjaśnienie tego zjawiska przedstawia model indukcyjnego dopasowania, który mówi,
że substrat i centrum aktywne mają różne struktury przestrzenne. Gdy dochodzi do powstawania
kompleksu E-S, substrat jest wciągany do centrum aktywnego, co powoduje
naprężenie wiązań składników tego kompleksu. Zmiana wiązań w substracie jest wynikiem wielkości
enzymu, który jest większy (większa masa ma mniejszą podatność na odkształcanie i jest bardziej
stabilna).