Podstawowym narzędziem badania struktur komórkowych jest technika mikroskopowania, która jednak nie umożliwia uzyskania dokładnych danych mówiących o funkcjach organelli komórkowych i składzie chemicznym. Spowodowało to, że ludzie nauki coraz częściej korzystają ze sprawdzonych technik pracy i metod wykorzystywanych w medycynie, fizyce oraz chemii, by zastosować je w badaniach komórek i tkanek wszystkich organizmów żywych. Posługiwanie się tymi metodami i technikami pracy wzbogaciło wiedzę pozyskaną dzięki mikroskopii oraz stanowi jej doskonałe uzupełnienie.