Częstym zjawiskiem w Japonii są tajfuny – gwałtowne wiatry powodujące wielkie zniszczenia. Nawiedzają one wybrzeża w sierpniu i we wrześniu, gdy słabnie monsun letni.
W przeważającej części Japonii roczna suma opadów atmosferycznych przekracza 1200 mm, a na południu dochodzi nawet do 4000 mm.
Ukształtowanie powierzchni Japonii i jej ciepły klimat sprzyjają rozwojowi bujnej roślinności. Aż 2/3 powierzchni tego kraju zajmują lasy. Na północy są to głównie lasy iglaste i mieszane, a na południu – zawsze zielone lasy podzwrotnikowe.
Najczęściej spotykanymi roślinami są: klon japoński, cedr japoński, miłorząb japoński i bambusy.
