W odizolowanych zagłębianiach wypełnionych wodą przesyconą węglanem wapnia powstają perły jaskiniowe. W środku każdej z nich znajduje się ziarnko, najczęściej piasku. Na nim koncentrycznie wytrącał się wapień. Dna jaskiń wyścielone są zwykle osadami namuliskowymi, przyniesionymi i pozostawionymi przez okresowo płynącą rzekę podziemną. W osadach tych spotyka się czasami szczątki roślin i zwierząt żyjących na powierzchni Ziemi. Jaskinia Niedźwiedzia w Masywie Śnieżnika swą nazwę zawdzięcza szczątkom niedźwiedzia jaskiniowego (Ursus speleogicus). Gatunek ten jednak najprawdopodobniej nie żył w jaskiniach. Kości niedźwiedzi przyniosły wody powodziowe i pozostawiły w namuliskach.