Bakterie są najczęściej haploidalne. W większości przypadków rozmnażają się przez bezpłciowo – przez podział komórki macierzystej na dwie komórki potomne. Z podziałem komórki zsynchronizowane jest podwojenie materiału genetycznego zawartego w genoforze. Komórki bakteryjne, zależnie od gatunku, dzielą się na drodze przewężenia lub przez powstanie w środku komórki nowej, przedzielającej ją ściany. U nielicznych bakterii występuje pączkowanie - proces, w którym komórka potomna powstaje przez uwypuklenie ściany komórki macierzystej. Częstotliwość podziałów bakterii zależy m.in. od warunków środowiskowych – gdy są one korzystne podziały zachodzą bardzo szybko, co 20 – 30 min. Jednakże te błyskawiczny sposób rozmnażania ma wielki „mankament”. Jego efektem zawsze jest powstanie osobników identycznych pod względem genetycznym.
