Nicienie nie posiadają układu oddechowego. Podobnie jak
płazińce, nicienie wolno żyjące prowadzą wymianę gazową całą powierzchnią ciała,
pasożyty potrafią oddychać beztlenowo.
Układ wydalniczy
nicieni zasadniczo odbiega budową od układu występującego u
wirków. Między innymi brak tu
komórek płomykowych, ale jest zaliczany do
układu protonefrydialnego. U większych przedstawicieli nicieni układ wydalniczy ma najczęściej kształt litery „H”. Składa się z dwóch kanałów biegnących w bocznych
wałkach hypodermalnych, otwierających się wspólnym otworem wydalniczym po brzusznej stronie ciała. Kanały te są zbudowane z niewielkiej liczby komórek (u
glisty ludzkiej tylko z dwóch). Układ wydalniczy służy nicieniom przede wszystkim do
osmoregulacji, natomiast w mniejszym stopniu do usuwania zbędnych i szkodliwych produktów przemiany materii.
