Przykładem symbiozy z udziałem grzybów jest ich współżycie z korzeniami niektórych drzew i roślin zielnych, zwane mikoryzą. Polega ona na tym, że strzępki grzyba wnikają pomiędzy komórki korzenia i pobierają związki organiczne – to tak zwana mikoryza zewnętrzna (ektotroficzna). Z mikoryzą wewnętrzną mamy do czynienia gdy strzępki grzyba wnikają do wnętrza komórek i również czerpią związki organiczne (mikoryza endotroficzna). W obu wypadkach ułatwiają roślinie pobieranie wody i prostych związków z gleby, czasami też dostarczają witamin i regulatorów wzrostu. Niekiedy bywa, że zależność jest tu tak duża, że rośliny pozbawione mikorytycznego grzyba giną.
