Wody Morza Bałtyckiego podlegają różnorodnym ruchom. Przez cieśniny duńskie, w przydennych warstwach przemieszczają się wlewy wód oceanicznych. Jest to związane z silnym zasoleniem – a przez to z większa gęstością tych wód. Wlewy oceaniczne najczęściej występują wiosną i jesienią, w czasie silnych sztormów. Wody z Bałtyku wypływają w przypowierzchniowych warstwach. Ponieważ cieśniny są stosunkowo płytkie, następuje silne mieszanie się przeciwstawnych prądów. Efektem są utrudnienia żeglugi w cieśninach.
Na tak małym akwenie falowanie jest ograniczone. Wysokość fal dochodzi maksymalnie do 4,3 m, a długość waha się od 10 do 75 m. Fale te często się krzyżują, co w połączeniu z ich małą długością czyni utrudnienia w żegludze po Bałtyku.