U nicieni ma on postać przewodu zaczynającego się otworem gębowym z jednej strony, a kończącego otworem odbytowym z drugiej. Przedni odcinek stanowi jelito przednie, a końcowy jelito tylne. Oba odcinki są pochodzenia entodermalnego. Otwór gębowy jest otoczony wargami, zaopatrzony w różnego typu ząbki, szczęki, sztyleciki, w zależności od gatunku i trybu życia nicienia. Za otworem gębowym znajduje się duża i silnie umięśniona gardziel. Jelito środkowe pochodzenia endodermalnego ma postać prostej rury. U pasożytów może dochodzić do redukcji układu pokarmowego i na przykład zaniku odbytu, a także jelita środkowego
