W przypadku alkenów występuje izomeria wiązania podwójnego - przy takim samym kształcie łańcucha węglowego związki różnią się lokalizacją wiązania podwójnego.
Jeżeli w alkenach występują dwa różne podstawniki, to mogą być położone po tej samej stronie wiązania podwójnego - izomer cis lub po przeciwnych - izomer trans (izomeria geometryczna).
