Pomiędzy Oceanem Spokojnym a Oceanem Atlantyckim przez obszar Syberii przebiega sieć hydrograficzna. Przez obszar Syberii przepływają duże i zasobne w wodę rzeki w obrębie których występują starorzecza, podmokłe obszary a także jeziora bagienne. Do największych rzek należą: Ob z Irtyszem, Jenisej z Angarą, Lena, Indygirka, Kołyma oraz Amur. Poziom wody w rzekach w ciągu roku jest dość wysoki zwłaszcza w okresie wiosennym gdy zaczynają topnieć śniegi. Z powodu nierównomiernego topnienia śniegów w obrębie rzeki często dochodzi do wylewów. Z kolei niektóre rzeki takie jak Amur uzależnione są od monsunów.
Jezioro Bajkał
