Mały Dunaj (słow. Malý Dunaj, węg. Kis Duna) - rzeka w zachodniej Słowacji ; jedno z trzech koryt, na które Dunaj dzieli się przepływając przez Małą Nizinę Węgierską . Długość - 128 km. Średni roczny przepływ (regulowany za pomocą śluz) - 19,3 m³/s w Bratysławie, 27,8 m³/s we wsi Trstice w końcowym biegu. Powierzchnia zlewni - 2.977 km².

Mały Dunaj odbija na wschód od głównego koryta Dunaju w Bratysławie (dzielnica Ružinov ) i płynie na południowy wschód przez Nizinę Naddunajską . Na początkowym odcinku, do wsi Most pri Bratislave, koryto Małego Dunaju jest sztuczne. Dalszy, naturalny bieg Małego Dunaju jest bardzo kręty i meandrowaty. Koryto rzeki ma szerokość 30-50 m. Do Małego Dunaju wpada tylko jeden większy dopływ - Čierna voda . 10 km dalej, koło miasta Kolárovo , Mały Dunaj wpada do Wagu .

Dorzecze Małego Dunaju stanowi w istocie system kanałów melioracyjnych różnej wielkości. Mały Dunaj ma także pewne znaczenie w systemie wodnym stworzonym przez zaporę w Gabčíkovie . Do osobliwości Małego Dunaju należą liczne zabytkowe młyny wodne - najbardziej znane we wsiach Jelka, Tomašikovo, Jahodna, Dunajsky Klatov.

Dunaj, Mały Dunaj i dolny odcinek Wagu (tzw. Vážsky Dunaj) otaczają największą wyspę rzeczną w Europie - Žitný ostrov .

Bliźniaczym do Małego Dunaju bocznym korytem Dunaju jest Dunaj Moszoński po południowej stronie głównego koryta Dunaju.